Oggi Eddy Merckx è attivo come imprenditore con il brand "Eddy Merckx Cycles", producendo biciclette di alta gamma e sponsorizzando squadre professionali. Partecipa a eventi come conferenze sulla storia del ciclismo e mentorship per giovani talenti, ad esempio attraverso la "Eddy Merckx Academy". È anche ambassador di gare internazionali, come il Giro delle Fiandre, promuovendo sostenibilità e innovazione tecnologica nelle competizioni.